Beliau menyelesaikan tesisnya yang membahas tentang perbandingan agama.
Kemudian setelah 14 tahun hidup di mekkah, beliau berhasil menyelesaikan studi S3 pada tahun 1994.
Pria yang lahir di Jawa Barat itu berhasil mempertahankan disertasinya dihadapan intelektual dari berbagai dunia dengan meraih predikat cumlaude.
Baca Juga: Biografi Soekarno, Sang Proklamator dari Sakit-sakitan hingga Tutup Usia
Ketika di Mekkah, ia juga menjalin kekerabatan dengan KH Abdurahman wahid atau Gusdur.
Pondok Pesantren Luhur Ats Tsaqafah didirikan oleh KH Said Aqil Siradj dimulai dari tahun 2011.
Namun baru 28 Juli 2013 memulai membuka pengajaran pada jenjang SMA.
KH Said Aqil Siradj juga merupakan salah satu lokomotif dakwah islam nusantara.
Beliau juga tercatat menjadi ketua forum kesatuan bangsa, menjadi penasihat ketua pusat kajian timur tengah dan Islam UI.
Tercatat ia juga pernah menjadi ketua penasihat gerakan anti diskriminasi.